北京大學(xué)第三醫(yī)院呼吸內(nèi)科是一個(gè)設(shè)備完善，臨床、科研和教學(xué)均頗具實(shí)力的優(yōu)秀專(zhuān)業(yè)科室。2012年獲國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科建設(shè)項(xiàng)目獎(jiǎng)。目前科室設(shè)置包括：呼吸普通病房2個(gè)（43張床位）、RICU（14張床位）、門(mén)診、肺功能室、支氣管鏡室、睡眠呼吸監(jiān)測(cè)室、霧化治療室、戒煙門(mén)診、藥理基地和實(shí)驗(yàn)室。呼吸內(nèi)科現(xiàn)有醫(yī)護(hù)人員95人，其中醫(yī)生42人，主任醫(yī)師7人、副主任醫(yī)師9人、主治醫(yī)師8人,住院醫(yī)師18人。呼吸科每年門(mén)診量均超過(guò)6萬(wàn)人次；病房（包括呼吸危重）收治來(lái)自全國(guó)各地的患者逾千人次。呼吸重癥監(jiān)護(hù)病房每年搶救危重癥近200余例，是醫(yī)院危重病救治平臺(tái)的重要組成部分。門(mén)診開(kāi)設(shè)了支氣管哮喘、慢性阻塞性肺病、鼾癥及戒煙專(zhuān)病門(mén)診，并定期開(kāi)設(shè)專(zhuān)病患者健康教育大講堂活動(dòng)，為患者提供便捷、專(zhuān)業(yè)、個(gè)性化的服務(wù)。
　　呼吸內(nèi)科臨床與科研并重,處理疑難、急危重癥能力強(qiáng)，對(duì)呼吸系統(tǒng)疾病進(jìn)行了深入研究，在呼吸醫(yī)學(xué)領(lǐng)域影響力大。呼吸科在慢性阻塞性肺疾?。–OPD）等呼吸內(nèi)科疾病研究領(lǐng)域內(nèi)，一直處于國(guó)內(nèi)領(lǐng)先水平。目前有多項(xiàng)研究成果獲國(guó)家、省部級(jí)以及中華醫(yī)學(xué)會(huì)的科研成果獎(jiǎng)勵(lì)。趙鳴武教授和姚婉貞教授曾經(jīng)分別擔(dān)任過(guò)中華醫(yī)學(xué)會(huì)呼吸病學(xué)分會(huì)COPD學(xué)組首任組長(zhǎng)和中國(guó)COPD聯(lián)盟負(fù)責(zé)人，參與了我國(guó)COPD診療指南的制定工作，呼吸科先后參與了有關(guān)COPD的國(guó)家十五攻關(guān)和十一五科技支撐項(xiàng)目等研究。
　　呼吸科在國(guó)內(nèi)較早獨(dú)立開(kāi)展了支氣管鏡以及內(nèi)科胸腔鏡檢查，多年來(lái)積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)，新進(jìn)開(kāi)展了超聲支氣管鏡、可彎曲內(nèi)科胸腔鏡檢查，大大提高了呼吸疑難病癥的診療水平。此外，呼吸科對(duì)于支氣管哮喘、呼吸系統(tǒng)感染性疾病、尼古丁成癮癥、睡眠呼吸暫停綜合征等疾病的診治等均具有豐富經(jīng)驗(yàn)。今后將進(jìn)一步開(kāi)展支氣管鏡下治療、脫敏治療等技術(shù)。
　　呼吸科具有較高的綜合臨床診治水平，每年接受來(lái)自全國(guó)各地的大量患者前來(lái)就診，并負(fù)責(zé)和接受北京及各地方醫(yī)院的呼吸疑難、危重病人的會(huì)診和轉(zhuǎn)診。許多不明原因發(fā)熱、各種感染性疾病、風(fēng)濕免疫疾病和系統(tǒng)性血管炎等疾病在呼吸科均得到了確診和治療。間質(zhì)性肺病是呼吸系統(tǒng)的疑難病，呼吸科采用多學(xué)科合作和不同的肺活檢技術(shù)對(duì)疾病進(jìn)行臨床和病理診斷，提高了該病的診斷和治療水平。目前呼吸科聯(lián)合放射科、病理科、胸科和核醫(yī)學(xué)科成立了呼吸科疑難疾病會(huì)診中心，為患者提供全方位、專(zhuān)業(yè)的診治方案。