重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院心胸外科成立于1974年，歷經(jīng)三十余載的不斷發(fā)展，現(xiàn)有開放床位75張（其中CICU床位15張），現(xiàn)有教授2名，副教授4名，主治醫(yī)師2名，住院醫(yī)師4名。
　　科室從上世紀(jì)80年代末開始開展體外循環(huán)心臟直視手術(shù)，著重致力于低體重、危重型、復(fù)雜型先心病的外科治療。現(xiàn)每年完成心臟直視手術(shù)600余例，總死亡率3％左右。手術(shù)最小年齡為生后1天，手術(shù)最低體重2.0公斤，目前1歲以下嬰兒已占心臟手術(shù)總數(shù)的50％以上，小于10公斤以下患兒占總數(shù)的70％以上。科室先后開展了大動(dòng)脈轉(zhuǎn)位、主動(dòng)脈縮窄或主動(dòng)脈弓中斷合并心內(nèi)畸形一期矯治、各型完全性房室通道、單心室、右室雙出口合并內(nèi)臟轉(zhuǎn)位矯治、各型完全性肺靜脈異位引流、三房心、Cantral五聯(lián)癥等均能施行手術(shù)矯治，近年來肺動(dòng)脈吊帶及血管環(huán)、外科微創(chuàng)封堵等手術(shù)治療均取得了良好效果。復(fù)雜先心病的手術(shù)數(shù)量及效果處于西部地區(qū)領(lǐng)先水平?，F(xiàn)年收治普胸患兒900余例。先天性漏斗胸微創(chuàng)NUSS矯形手術(shù)、自主開發(fā)創(chuàng)新的胸骨懸吊矯治漏斗胸手術(shù)均達(dá)到全國先進(jìn)水平。新生兒先天性食管閉鎖手術(shù)連續(xù)50例無死亡，氣管支氣管異物一次取盡率達(dá)99.5%，新生兒危重型膈疝手術(shù)死亡率低于5%，在診治其他疾病方面也有豐富經(jīng)驗(yàn)，如食道裂孔疝、胸腔及縱隔腫瘤、肺先天性疾病、心包炎、膿胸、頸靜脈擴(kuò)張、雞胸，科室還開展了小兒先心外科封堵術(shù)。