上海中山醫(yī)院消化科由著名內科學家林兆耆教授于1953年創(chuàng)立，1978年正式建科，朱無難教授任首任主任。1983年，劉厚鈺教授任主任。1999-2009年，王吉耀教授任主任?，F任主任為沈錫中教授。消化科擁有一支高水平的專業(yè)隊伍。?？崎T診每周6天，由副教授和主治醫(yī)師輪流坐診；每周6天均開設專家門診。2012年門診人數已逾20萬人次，其中專家門診逾6萬。目前中山醫(yī)院消化科設有兩個獨立的病區(qū)，共有核定床位106張，2012年出院人數達4100人次。住院病人多為來自全國各地的疑難重危病人，臨床綜合實力強，診治水平高。是衛(wèi)生部?？漆t(yī)師培訓基地、國家藥品監(jiān)督管理局中山醫(yī)院臨床藥理基地單位、內科博士點和博士后流動站。設有自身免疫性肝病、脂肪肝、慢性病毒性肝炎、慢性肝病、幽門螺桿菌、內鏡治療、腸道疾病、胃食管反流等專病及特色門診。是我國最早開展肝穿刺的單位之一，病理診斷水平全國一流。消化科每周開展科內業(yè)務學習，包括最新研究進展及疑難病例討論，每月一次臨床病理討論（和復旦大學上海醫(yī)學院病理科、中山醫(yī)院病理科聯合），每年主辦國家級繼續(xù)教育項目兩項：肝病治療進展學習班、循證醫(yī)學與臨床實踐學習班。在國內首先提出循證醫(yī)學的概念，并將臨床流行病學研究應用于胃腸以及肝臟病學研究，處于國內領先水平。在慢性肝病診治、肝纖維化機制、內鏡治療等領域的研究水平名列全國前茅，承擔多項國家自然科學基金研究課題、上海市科委和863課題。研究成果“幽門螺桿菌關鍵致病因子CagA、 VacA的生物學特性及其臨床應用”獲國家科技進步二等獎 （第二完成單位） （2007）、“肝纖維化細胞分子機制與治療策略”獲上海醫(yī)學科技一等獎及中華醫(yī)學科技三等獎（第一完成單位）（2008）、“消化道腫瘤及慢性肝病靶向納米藥物載體研制”獲上?？萍歼M步二等獎及教育部科技進步二等獎（第一完成單位）（2007）、“慢性乙型病毒性肝炎肝纖維化非創(chuàng)傷性診斷體系的建立及其診斷價值的研究”獲上海醫(yī)學科技二等獎（第三完成單位）（2006）、“慢性乙型病毒性肝炎肝纖維化非創(chuàng)傷性診斷和氧化苦參堿的治療作用” 獲中華醫(yī)學科技三等獎（第三完成單位）（2006）。目前消化科共有醫(yī)師31名（不包括在大內科進行規(guī)范化培訓的住院醫(yī)師），包括正高5名、副高10名、主治醫(yī)師14名、完成規(guī)范化培訓的住院醫(yī)師2名。其中獲博士學位20人，碩士學位9人，學士學位2人。