在StoRM研究中納入的1250名女性乳腺癌患者，在2012年3月-2014年5月間出現(xiàn)腫瘤轉(zhuǎn)移，研究者使用人核心外顯子組芯片集進(jìn)行研究，能夠檢測(cè)到超過(guò)250000種變異，其中在核心區(qū)域超過(guò)了200000種變異。

StoRM研究計(jì)劃補(bǔ)充SIGNAL/PHARE （NCT00381901/RECF1098）隊(duì)列至超過(guò)10,000個(gè)早期乳腺癌病人，由臨床團(tuán)隊(duì)隨訪(fǎng)病人的治療、生存，獲取病人的基因背景信息，以此來(lái)研究基因類(lèi)型與乳腺癌轉(zhuǎn)移的相關(guān)性。

在研究中，從疾病的診斷到出現(xiàn)腫瘤轉(zhuǎn)移，平均觀(guān)察時(shí)間在6年以?xún)?nèi)。

研究結(jié)果：

在StoRM隊(duì)列中，從早期乳腺癌診斷到腫瘤轉(zhuǎn)移的平均時(shí)間段為58.5 （±73.5）個(gè)月。747個(gè)病人為 luminal 型，249個(gè)病人為 HER2 陽(yáng)性型，194個(gè)病人為T(mén)NBC。

截止2017年4月，在StoRM隊(duì)列中，875名病人死亡。截止2017年7月，SIGNAL隊(duì)列平均隨訪(fǎng)時(shí)間為3.8年，PHARE隊(duì)列隨訪(fǎng)時(shí)間為7年。在SIGNAL/PHARE隊(duì)列中，1497名病人出現(xiàn)疾病進(jìn)展，154名病人死亡。

研究者發(fā)現(xiàn)患者生存情況與腫瘤類(lèi)型高度相關(guān)（p = 2.27x10-38），TNBC在腫瘤轉(zhuǎn)移后，平均生存時(shí)間不超過(guò)24個(gè)月，然而 luminal 型和 HER2 陽(yáng)性病人則超過(guò)36個(gè)月。

研究結(jié)論：

該研究讓我們能夠更好的了解基因類(lèi)型如何影響乳腺癌病人的預(yù)后。通過(guò)SIGNAL/PHARE和StoRM臨床隊(duì)列研究了乳腺癌病人的基因和治療反應(yīng)以及生存之間的關(guān)系?；蜃儺惖念?lèi)型與治療反應(yīng)相關(guān)，在未來(lái)的研究中，這些相關(guān)性可能被進(jìn)一步的研究清楚。

來(lái)自法國(guó)國(guó)家健康和醫(yī)療研究所的Nina Radosevic-Robin和美國(guó)紐約Sloan Kettering癌癥中心的合作者在兩項(xiàng)新輔助治療（抗EGFR的帕尼單抗和西妥昔單抗聯(lián)合化療治療局部晚期的TNBC）的臨床試驗(yàn)中研究了與疾病復(fù)發(fā)可能相關(guān)的基因組的決定因素。

研究者使用NGS分析了治療前的腫瘤組織樣品和治療后的殘留組織樣品，使用一個(gè)含有410個(gè)腫瘤相關(guān)基因的外顯子靶點(diǎn)檢測(cè)（MSK-IMPACT）。分析顯示了15個(gè)獲得完全緩解（pCR）的病人的數(shù)據(jù)和33個(gè)沒(méi)有完全緩解的病人（non-pCR）的數(shù)據(jù)。

研究結(jié)果：

33個(gè)沒(méi)有獲得完全緩解的病人中，有9個(gè)人在術(shù)后2年之內(nèi)復(fù)發(fā)。

在這些病人中，有5個(gè)病人在早期（術(shù)后1年之內(nèi)）經(jīng)歷了致命性的腫瘤轉(zhuǎn)移。還有5個(gè)病人（1個(gè)PCR，4個(gè)non-pCR）在較晚的時(shí)期內(nèi)（1年之后，2年之內(nèi)）出現(xiàn)了非致命性的復(fù)發(fā)。

23例有殘余腫瘤的病人在術(shù)后5年沒(méi)有出現(xiàn)復(fù)發(fā)。在15個(gè)獲得PCR的病人之中，一個(gè)病人在較晚的時(shí)候出現(xiàn)非致命性的單發(fā)的腦轉(zhuǎn)移。

分析顯示，出現(xiàn)疾病復(fù)發(fā)的病人產(chǎn)生了特異性的基因組改變。

復(fù)發(fā)組出現(xiàn)的一些常見(jiàn)的基因改變

疾病復(fù)發(fā)和NGS結(jié)果的關(guān)系被一例例分析，并發(fā)現(xiàn)了病人特異性的基因改變，沒(méi)有明顯的預(yù)測(cè)腫瘤復(fù)發(fā)的基因模式。有趣的是，SOX9擴(kuò)增在3/5的早期出現(xiàn)致命性轉(zhuǎn)移的病人中被發(fā)現(xiàn)，在這一組中，沒(méi)有別的發(fā)現(xiàn)。新輔助治療后有腫瘤殘留且經(jīng)歷了早期致命性的腫瘤轉(zhuǎn)移的病人，有一個(gè)單獨(dú)的基因組異常設(shè)置。

例如：

第一個(gè)病人沒(méi)有突變，但是有SOX9，AKT1和TGFBR2擴(kuò)增，還有TERT缺失。

第二個(gè)病人有SOX9，RAD21和NOTCH2擴(kuò)增，還有PTEN，PIK3CA，ERBB3和ARID1B突變。

第三個(gè)病人有SOX9和MYC擴(kuò)增，PTEN丟失和KDM6A突變。

第四個(gè)病人有RAF1， FGFR2，MLL2和GLI1突變， 還有一些其它基因的拷貝數(shù)改變。

第五個(gè)病人有SETD2突變，HIST2H3D，HIST2H3C，MCL1和EZH2擴(kuò)增，還有MAP3K1丟失。

那個(gè)獲得PCR但是后來(lái)出現(xiàn)單發(fā)腦轉(zhuǎn)的病人在治療前的樣品中有BRCA1, MLL2, CDK12和PPM1D突變。

在其它的non-pCR病人中，檢測(cè)到了一些基因組的異常，例如在一個(gè)殘余腫瘤中，檢測(cè)到了3種不同PIK3CA的活性突變，治療后的標(biāo)本中出現(xiàn)了HRAS G12S突變或PARP1擴(kuò)增。

研究結(jié)論：

這個(gè)研究讓我們注意到：SOX9擴(kuò)增是TNBC的一個(gè)潛在的耐藥機(jī)制和腫瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制。盡管研究規(guī)模較小，但證實(shí)了TNBC腫瘤內(nèi)部的異質(zhì)性，并且需要在其它的腫瘤中來(lái)解釋NGS的發(fā)現(xiàn)，比如組織學(xué)、基因和蛋白表達(dá)和免疫。

題圖來(lái)源：123RF圖庫(kù)